Helsingin vesiympäristön tilaan vaikuttavat Itämeren tila, hulevesien laatu, työmaavesien kuormitus sekä hajakuormituksen tuomat ravinteet. Vesistöt ovat tärkeitä kaupunkilaisten hyvinvoinnille, maisemalle ja virkistyskäytölle. Vesistöt toimivat myös osana ekologista verkostoa: ne ylläpitävät luonnon monimuotoisuutta, auttavat tulvasuojelussa ja tasaavat ympäristön lämpötilavaihteluita. Vesistöjen hyvän tilan saavuttaminen on sitovaa EU-lainsäädäntöä.
Vesiensuojelua toteutetaan muun muassa Itämeri-toimenpideohjelmalla 2024–2028 sekä ympäristöviranomaisen laillisuusvalvonnalla. Vesiensuojelu on lisäksi integroitu osaksi kaupunkikehitystä, kuten Helsingin luonnonsuojelualueohjelmaa 2025–2038 ja Merellinen Helsinki -toimenpideohjelmaa.
